娛樂城|您的嘴裡放著各種各樣的細菌

細菌通常表現出很強的生物地理學-一些細菌在特定位置富集而其他細菌則不存在-在將微生物學應用於治療劑或益生菌時引發了主要問題:細菌如何進入錯誤的位置?當生物地理學已經“擺脫重創”時,我們如何將正確的細菌添加到正確的位置?這些問題是一個巨大的障礙,細菌是如此之細,數量眾多,具有非常多樣和復雜的人口,這給理解帶來了重大挑戰哪些亞類生活在何處,哪些基因或代謝能力使它們在這些“錯誤的”地方places壯成長。 基因組生物學。ogy 哈佛大學領導的研究人員檢查了人類口腔微生物組,發現了生活在口腔某些區域的細菌亞群的驚人變化。“作為微生物生態學家,我們著迷於細菌如何將任何棲息地劃分為各種生態位,但人類本身卻如此,我們也對微生物如何娛樂城哈佛大學生物與進化生物學系的首席候選人丹尼爾·R·厄特說:“測序技術和生物信息學方法的最新發展提供了解決細菌群落複雜性的新方法。” Colleen Cavanaugh,哈佛大學生物與進化生物學系愛德華·C·杰弗裡(Edward C. Jeffrey)生物學教授,芝加哥大學伍茲霍爾海洋生物學實驗室和福賽斯研究所的研究人員合作,將這些該大學的醫學系助理教授A. Murat Eren認為,“嘴是研究微生物群落的理想場所”,它可以為口腔微生物組提供更好的圖像。不僅是胃腸道的開始,而且還是一個非常特殊的小型環境,微生物的多樣性足夠這樣我們才能真正開始回答有關微生物群落及其進化的有趣問題。”在不同區域,口腔中含有數量驚人的特定部位微生物。例如,在舌頭上發現的微生物與在牙齒上的牙菌斑上發現的微生物非常不同。 “您的舌頭微生物與生活在別人舌頭上的微生物相比,更像是生活在您的喉嚨或牙齦上的微生物!”埃倫說,研究小組搜索了公共數據庫並下載了100個基因組,這些基因組代表了口腔中常見的四種細菌,副流感嗜血桿菌和Rothia屬的三種口腔物種,並以此為參考來調查數百名志願者中抽樣的親屬烏特說:“我們以這些基因組為起點,但很快就超越了它們,以探測生活在我們嘴中的數万億細菌細胞中的總遺傳變異。” “因為,歸根結底,這就是我們所好奇的,而不是被測序的任意少數。”使用這種最近開發的方法,稱為超泛基因組學,該方法結合了泛基因組(一組中所有基因的總和)宏基因組學(對來自社區中所有細菌的總DNA進行研究),使研究人員能夠對微生物的基因組進行深入檢查,從而得出令人震驚的發現。”數量多變”,Utter說。 “但是我們對口腔不同部位的這種變化規律感到震驚,特別是在舌頭,臉頰和牙齒表面之間娛樂城評價例如:“在一個微生物物種中,研究人員發現了與口腔內單個不同部位密切相關的獨特遺傳形式。在許多情況下,研究小組能夠鑑定出少數可能解釋特定基因的基因。細菌群體的特定棲息地。應用超基因組學,研究人員還能夠確定人體內自由生存細菌的特定方式娛樂城評價這些技術所提供的分辨率-通過直接比較“馴養”和“ wi娛樂城評價“細菌-使我們能夠逐個基因地剖析這些差異,”卡瓦諾指出。 “我們還能夠鑑定出與培養物中的細菌菌株相關但又不同的新型細菌菌株。”“已經鑑定出一些非常強大的候選細菌,這些候選菌株可以確定對特定棲息地的適應性,我們想通過實驗檢驗這些假設, ”卡瓦諾說。這些發現可能是解鎖目標益生菌的關鍵,在這裡,科學家們可以利用對每種微生物的棲息地的要求所學到的知識,將有益的微生物工程化到特定的棲息地。海洋生物學實驗室的副研究員傑西卡·馬克·韋爾奇(Jessica Mark Welch)說:“我們的嘴很長一段時間。我們所看到的每個環境都有這些真正複雜的細菌群落,但是為什麼呢?”馬克·韋爾奇說。 “了解這些群落為何如此復雜以及不同細菌如何相互作用將幫助我們更好地了解如何修復損害我們健康的細菌群落,並告訴我們哪些微生物需要清除或重新添加。”這項研究以及其他類似的研究可以提供有關口腔微生物在人類健康中的作用的新見解。烏特說:“能夠識別棲息地適應性背後的特定基因的能力在微生物生態學上有些“聖杯”。 “我們為我們在這一領域的貢獻感到非常興奮!”參考:Utter DR,Borisy GG,Eren AM等。口腔微生物組的超基因組學提供了關於棲息地適應性和品種多樣性的見解。 基因組生物學。 2020; 21(293)。 doi:10.1186 / s13059-020-02200-2本文已通過以下材料重新發表。注意:材料的長度和內容可能已被編輯。有關更多信息,請聯繫引用的來源。