娛樂城|繼續跟踪SARS-CoV-2如何傳播和發展

艾默里大學生物學副教授Katia Koelle說,SARS-CoV-2病毒變種的出現在對抗COVID-19的鬥爭中增加了曲折,表明需要對該病毒進行更好的基因組監測。 Koelle說:“改善跨州SARS-CoV-2的基因組監測確實將幫助我們更好地了解引起大流行的病毒在美國的發展和傳播。” “需要更多的聯邦資金,以及用於樣品收集和基因測序的集中標準。研究人員需要訪問這樣的元數據,以更好地跟踪病毒在地理上的傳播方式,並確定可能難以控制的任何新變種,以便衛生官員可以更快,更有效地做出響應。” Koelle研究了病毒進化與病毒傳染病流行病學傳播之間的相互作用。她是《科學》(科學)上發表的一篇“觀點”文章的高級作者,該文章談到SARS-CoV-2測序對控制COVID-19大流行的重要性。邁克爾·馬丁(Michael Martin)是埃默里(Emory)的人口,生物學和生態計劃的博士研究生,也是科勒(Koelle)實驗室的成員,是《科學》雜誌的第一作者。合作作者是Koelle實驗室的博士後研究員David VanInsberghe。馬丁說:“對SARS-CoV-2的研究一直以迅雷不及掩耳的速度進行。” “這種加速為我們提供了有史以來針對疾病快速組裝的最大的數據集之一。到目前為止,我們已經學到了很多有關這種病毒如何傳播和適應的知識,但是仍然有很多盲點需要解決。”本文總結了有關SARS-CoV-2的關鍵見解,這些見解已通過從各個患者樣品中對其基因組進行測序而獲得。它還列舉了仍然存在的挑戰,包括將元數據收集和整合到遺傳分析中,以及需要開發更有效和可擴展的計算方法以應用於成千上萬的基因組的需求。基因組是生物體的遺傳物質。人類基因組由雙鏈DNA組成,以四個不同的核苷酸鹼基字母編碼。一個人類基因組由超過30億個鹼基對組成。相反,包括SARS-CoV-2在內的冠狀病毒的基因組是由RNA組成的,RNA的結構比DNA更簡單。例如,SARS-CoV-2基因組由一條只有30,000個字母長的RNA鏈組成。排序是一種可以讀取這些字母的技術。如果在從某人的鼻子或嘴巴擦拭的樣本中發現SARS-CoV-2病毒,則可以確認娛樂城評價無論是否患有COVID-19症狀,一個人都攜帶病毒。樣品中的病毒也可以測序。 “對病毒進行測序就像對其進行指紋識別一樣,” Koelle解釋說。 “並且基於指紋在樣本之間匹配的接近程度-tha娛樂城推薦是的,它們在遺傳上有多緊密-有時您可以了解誰正在感染誰。隨著時間的推移,分析來自給定區域中受感染個體的樣本序列可以提供更多信息。” SARS分析娛樂城評價-CoV-2測序數據使研究人員能夠估計SARS-CoV-2溢出到人體內的時間;確定其全球傳播的一些傳播途徑;確定感染率及其在一個區域內的變化;並確定一些令人關注的新變體的出現。病毒基因組可以在復製過程中發生突變,並在傳播給新人們時改變字母。這些隨機突變中的大多數可能不會影響病毒的傳播性或毒力,但其中一些可能會使它更難以抵抗。例如,早期證據表明,最近在英國出現的SARS-CoV-2變體可能更容易傳播,而且可能更嚴重。南非的一種變體顯示出可能會降低現有疫苗效力的跡象,而巴西首次發現的一種變體還包含一些突變,衛生官員擔心這些突變會使病毒傳播得更快。馬丁解釋說:“由於混雜因素,很難鑑定出哪些變異真正改變了病毒的複制,傳播和致病方式。” “例如,如果某個變體傳播得更快,那麼您就必須弄清楚這是因為它變得更易傳播,還是被某個感染它的人參加了一次大型聚會。”他補充說,研究人員擁有的數據越好,他們解決此類難題的速度就越快。近年來,技術的進步使得生成測序數據的效率更高,成本更低。在它出現僅僅一年後,現在公共數據庫中已有超過40萬個SARS-CoV-2序列,例如GISAID平台,該平台於2008年啟動,用於在世界衛生組織全球流感監測和應對系統的國家流感中心之間共享信息。 Koelle指出:“ SARS-CoV-2的大部分公共測序數據都來自英國。” “這是因為英國政府主動對SARS-CoV-2基因組進行高密度採樣。”來自英國的豐富數據集有助於識別新興市場娛樂城在英國迅速傳播的變種ce。 Koelle說:“除了已經發現的那些問題以外,在世界其他地方可能還會出現其他令人擔憂的問題,但我們只是不知道,因為我們在那些地方沒有足夠的監視能力。” “儘管美國在從全國樣本中對SARS-CoV-2進行測序的工作進展緩慢,但主要由學術研究人員推動的一些出色的病毒測序工作和系統發育分析有助於理解SARS-CoV-2傳播更多地本地化。” Koelle說。 “我們在美國擁有專業知識,但工作更加零散。”馬丁說:“我們需要一項協調一致的,全國標準化的計劃,以對SARS-CoV-2進行廣泛的測序。” “現在收集的許多數據僅具有狀態標識符,但我們需要更高的分辨率,同時還要保護患者的隱私。例如,更多的縣級標識符將是大大提高數據質量和深度的一種方法。”兩位研究人員強調,一旦COVID-19大流行病消退,繼續建立國家基礎設施和系統以進行傳染病監測(包括病毒測序)並保持其就位就很重要。馬丁說:“將會有更多的傳染病大流行,我們需要作更好的準備。”參考文獻:Martin MA,VanInsberghe D,KoelleK。SARS-CoV-2序列的見解。 科學2021; 371(6528):466。 doi:10.1126 / science.abf3995。該文章已從以下材料重新發布。注意:材料的長度和內容可能已被編輯。有關更多信息,請聯繫引用的來源。